Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Itga4Q00651 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms