Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VegfcP97953 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfcP97953 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms