Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PrkdcP97313 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PrkdcP97313 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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