Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H3f3aP84244 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms