Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Otx1P80205 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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