Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irf3P70671 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms