Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tp53bp1P70399 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tp53bp1P70399 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tp53bp1P70399 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tp53bp1P70399 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tp53bp1P70399 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tp53bp1P70399 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tp53bp1P70399 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tp53bp1P70399 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms