Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgf11P70378 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgf11P70378 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms