Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad1P70340 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad1P70340 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms