Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbx6P70327 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms