Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp3P70281 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms