Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp7P70280 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms