Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad54lP70270 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad54lP70270 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms