Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkn1P70268 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkn1P70268 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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