Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chl1P70232 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Chl1P70232 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chl1P70232 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chl1P70232 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chl1P70232 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chl1P70232 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chl1P70232 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms