Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf6P70196 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf6P70196 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms