Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkacbP68181 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms