Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps4xP62702 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps4xP62702 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms