Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snrpd1P62315 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd1P62315 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms