Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lsm3P62311 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm3P62311 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms