Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp46P62069 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp46P62069 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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