Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Depdc5P61460 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms