Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg6P61406 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smg6P61406 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smg6P61406 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smg6P61406 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms