Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr2fP61219 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr2fP61219 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms