Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Actr1aP61164 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms