Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ythdf1P59326 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms