Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf2P59222 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms