Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctdsp1P58466 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms