Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtnsP57757 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms