Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Irf5P56477 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Irf5P56477 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms