Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pex2P55098 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Pex2P55098 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pex2P55098 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pex2P55098 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms