Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GemP55041 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GemP55041 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GemP55041 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GemP55041 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GemP55041 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GemP55041 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms