Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ephb3P54754 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ephb3P54754 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms