Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Map3k1P53349 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Map3k1P53349 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms