Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgd1P52734 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgd1P52734 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms