Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox5P52651 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox5P52651 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms