Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClgnP52194 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ClgnP52194 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms