Protein–RNA interactions for Protein: P51678

Ccr3, Probable C-C chemokine receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr3P51678 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr3P51678 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr3P51678 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms