Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RorcP51450 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RorcP51450 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RorcP51450 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RorcP51450 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RorcP51450 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms