Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf10P50592 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf10P50592 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms