Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc13P50207 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc13P50207 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms