Protein–RNA interactions for Protein: P48381

Rfx3, Transcription factor RFX3, mousemouse

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx3P48381 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rfx3P48381 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx3P48381 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx3P48381 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rfx3P48381 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms