Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VdrP48281 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VdrP48281 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VdrP48281 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VdrP48281 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VdrP48281 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VdrP48281 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VdrP48281 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VdrP48281 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VdrP48281 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VdrP48281 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VdrP48281 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VdrP48281 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VdrP48281 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VdrP48281 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms