Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlx1P43345 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms