Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc19a1P41438 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc19a1P41438 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms