Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Chd1P40201 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Chd1P40201 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd1P40201 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd1P40201 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms