Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ddit3P35639 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms