Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rfc1P35601 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms