Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rab5cP35278 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rab5cP35278 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms