Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rom1P32958 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms